Свято-Филаретовский православно-христианский институт принял имя свт. Филарета Московского в 1995 году, за год до его общецерковного прославления.

Митрополит Московский Филарет (Дроздов) был одним из самых выдающихся церковных деятелей XIX века. Будучи блестящим проповедником и администратором, сыграл значительную роль в становлении русской духовной школы. Он был сторонником просвещенной веры, т.е. веры разумной.

Идея о необходимости просвещения народа Божьего была центральной в жизни святителя и проявлялась многогранно: в его заботе о переводе Библии на русский язык, в написании «Пространного катехизиса», в преподавательской деятельности и, конечно, в проповеди. Святитель Филарет утверждал: «Если не будет Церкви живой, то есть верующих человеков: церковь каменная или разрушится, быв оставлена без попечения, или, по крайней мере, останется пуста и бесполезна». Свято-Филаретовский институт принял имя святителя Филарета, как свидетельство приверженности традиции, любви и признательности этому подвижнику веры, носителю духа и смысла в церкви.